Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubgcp4Q9D4F8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms