Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms