Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpn3Q9D3W4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms