Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms