Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D2Q3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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