Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D930007J09RikQ9D2K6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms