Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fndc8Q9D2H8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fndc8Q9D2H8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms