Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms