Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms