Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D1F3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms