Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms