Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syf2Q9D198 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms