Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Susd3Q9D176 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Susd3Q9D176 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms