Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl52Q9D0Y8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mrpl52Q9D0Y8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms