Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm12Q9D0R8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms