Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zbed3Q9D0L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed3Q9D0L1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms