Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms