Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shmt2Q9CZN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms