Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nde1Q9CZA6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nde1Q9CZA6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms