Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
3110001I22RikQ9CZ70 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms