Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snf8Q9CZ28 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snf8Q9CZ28 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms