Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prelid3bQ9CYY7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prelid3bQ9CYY7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prelid3bQ9CYY7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prelid3bQ9CYY7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms