Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mis12Q9CY25 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mis12Q9CY25 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms