Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx7Q9CY18 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms