Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms