Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Xrcc3Q9CXE6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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