Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mgme1Q9CXC3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms