Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms