Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pin4Q9CWW6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms