Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkrip1Q9CWV6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms