Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CWU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9CWU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms