Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms