Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smyd3Q9CWR2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smyd3Q9CWR2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms