Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnot11Q9CWN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cnot11Q9CWN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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