Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rhobtb3Q9CTN4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms