Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snw1Q9CSN1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snw1Q9CSN1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms