Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pard3bQ9CSB4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms