Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd3Q9CRB9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd3Q9CRB9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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