Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox16Q9CR63 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox16Q9CR63 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms