Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl28Q9CR40 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms