Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PompQ9CQT5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms