Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mri1Q9CQT1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms