Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Chchd5Q9CQP3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Chchd5Q9CQP3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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