Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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