Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms