Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms