Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138Q9CQE0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms