Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpl39lQ9CQD0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl39lQ9CQD0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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