Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sar1bQ9CQC9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms