Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQC3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms